Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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