Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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