Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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