Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms