Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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FOXE3Q13461 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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