Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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