Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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