Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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