Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms