Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SALL4Q9UJQ4 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms