Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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