Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms