Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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