Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms