Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP13Q15645 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms