Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SIX1Q15475 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SIX1Q15475 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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SIX1Q15475 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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SIX1Q15475 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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