Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms