Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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COL4A6Q14031 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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COL4A6Q14031 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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COL4A6Q14031 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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