Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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