Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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