Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PTP4A2Q12974 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PTP4A2Q12974 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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