Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms