Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FGD1P98174 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FGD1P98174 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms