Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AMPD1-201ENST00000369538 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms