Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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