Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CEP290O15078 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CEP290O15078 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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CEP290O15078 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CEP290O15078 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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