Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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