Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms