Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms