Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms