Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HTR4Q13639 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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