Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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