Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ITGB3BPQ13352 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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ITGB3BPQ13352 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ITGB3BPQ13352 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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