Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3BQ13214 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms