Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APOBRQ0VD83 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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