Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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