Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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