Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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