Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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