Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms