Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms