Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms