Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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