Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2J1Q9Y385 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms