Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS2Q9Y248 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS2Q9Y248 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms