Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms