Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms