Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms