Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms