Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH7Q9ULB5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms